Ingénieur séquençage haut débit NGS H/F
CDD Fontenay-aux-Roses (Hauts-de-Seine) Conception / Génie civil / Génie industriel
Description de l'offre
Détail de l'offre
Informations générales
Entité de rattachement
Le Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) est un organisme public de recherche.Acteur majeur de la recherche, du développement et de l'innovation, le CEA intervient dans le cadre de ses quatre missions :
. la défense et la sécurité
. l'énergie nucléaire (fission et fusion)
. la recherche technologique pour l'industrie
. la recherche fondamentale (sciences de la matière et sciences de la vie).
Avec ses 16000 salariés -techniciens, ingénieurs, chercheurs, et personnel en soutien à la recherche- le CEA participe à de nombreux projets de collaboration aux côtés de ses partenaires académiques et industriels.
Référence
2019-8253Description de l'unité
Le Plan France Médecine Génomique 2025 (PFMG 2025) est un plan national piloté et soutenu par l'État. Il vise à positionner la France dans le peloton de tête des grands pays engagés dans la médecine génomique. Il est mis en œuvre par l'Alliance nationale pour les sciences de la vie et de la santé (Aviesan) qui regroupe les principaux acteurs de la recherche publique en biologie et santé (CEA, CHRU, CNRS, CPU, INRA, Inria, Inserm, Institut Pasteur, IRD).
Le PFMG 2025 vise à déployer les instruments du parcours de soins génomique. Il s'articule autour de trois grands objets :
• un réseau de douze plateformes de séquençage à visée sanitaire couvrant l'ensemble du territoire français. Les deux premières plateformes de séquençage, SeqOIA (Ile de France) et AURAGEN (Auvergne Rhône-Alpes) sont entrées en fonction en décembre 2018 et atteindront leurs objectifs cibles fin 2019. Les plateformes de séquençage suivantes seront choisies à partir de 2020.
• un Collecteur analyseur de données (CAD) mettant en place les outils pour exploiter les volumes de données générées.
• un Centre de référence, d'innovation, d'expertise et de transfert (CRefIX) permettant d'assurer les développements technologiques indispensables à la mise en œuvre du parcours.
Le CRefIX est une Unité Mixte de Service (UMS) entre l'Inserm, le CEA et l'Inria. Il est piloté par le directeur du Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH), Jean-François Deleuze, pour le CEA et Alain Viari pour l'Inria.
Description du poste
Domaine
Biologie, biophysique et biochimie
Contrat
CDD
Intitulé de l'offre
Ingénieur séquençage haut débit NGS H/F
Statut du poste
Cadre
Durée du contrat (en mois)
12 à 36
Description de l'offre
Dans le cadre du CRefIX, au laboratoire L2PGH du CNRGH, vous assurerez les missions suivantes :
- rédaction et suivi de procédures d’exploitation normalisées (SOP, standard operating procedures) pour le séquençage « humide », de l’extraction des acides nucléique au séquençage proprement dit ;
- tests et veille technologique et technique ;
- évaluation des solutions organisationnelles existantes (benchmark).
Les aspects associés au séquençage « humide » du CRefIX sont localisés au CNRGH sur la Génopole d’Evry (91), 30 km au sud de Paris.
Profil recherché
Profil du candidat
Titulaire d'une thèse ou d'un diplôme d'Ingénieur en biologie moléculaire, vous possédez de solides connaissances en biologie moléculaire et une expérience confirmée en NGS.
Compétences Requises
Aptitudes :
- dynamisme et curiosité ;
- esprit de synthèse ;
- sens de l'organisation, rigueur, respect des règles ;
- bon relationnel ;
- rigueur et autonomie ;
- capacités à communiquer au sein d'équipes pluridisciplinaires ;
- savoir présenter ses résultats à l'oral et par écrit en français et anglais ;
Connaissances techniques :
- Compréhension de la problématique scientifique ;
- connaissances théoriques et pratiques approfondies en biologie moléculaire, préparation de librairies et séquençage haut débit (NGS) ;
- connaissance de la robotique associée à la préparation de librairies et au séquençage de haut débit ;
- capacités rédactionnelles techniques
- anglais courant requis.